“ダウンリンクが100Mbps程度しかでてないことが時々発生しています．その場合もアップリンクは1Gbps近くでており，インターフェイスとしては1Gとして認識されています．”
ポートのlink speed設定は1Gのまま変動していないと読み取れるのですが、仮に当該ポートのlink speed自体が変動しているかについてはアラート発報させることやログ表示に出ます。
文章から問題はこれではないと思いますが、未確認の場合は当該イベント前後のlink speed状況確認します。
アラートと通知 - Cisco Meraki
>Any/specific port changes link speed
MS イベント ログ エントリと定義 - Cisco Meraki
>Port Status Change
なお、MSのsyslogでは現在eventのみのサポートです。
Syslogサーバーの概要と設定 - Cisco Meraki
>Syslogメッセージのタイプ
Syslog イベント タイプとログ サンプル - Cisco Meraki
>port status change
QoS設定無く、link speedは1Gのまま、100Mbps程度の速度へ低減している場合。
・syslog（対応する記載なし）
・alert（対応する記載なし）
・API report（対応する記載なし）
・Meraki Webhook（alertで設定可能なもの、つまり無し）
・SNMP（対応する記載なし）
Meraki Device Reporting - Syslog, SNMP, and API - Cisco Meraki
・Meraki APIでもちょっと見つからないですね。。
Meraki Developer Hub – Deploy, Build, & Engage - Cisco DevNet
Cisco MerakiダッシュボードAPI - Cisco Meraki
他有用なもの見つからず、仰っしゃられるようにMS側ではなく外から監視ということになりそうです。
端末はどういったもので測定させるかになるかと思いますが、ポートミラーさせる場合は設定部分を以下においておきます。
スイッチ ポート - Cisco Meraki
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